Пока это только заметки для себя, поэтому в них чёрт ногу сломает.
В описании установки предлагается создать директории для данных
sudo mkdir /var/lib/phpfiwa
sudo mkdir /var/lib/phpfina
sudo mkdir /var/lib/phptimeseries
sudo chown www-data:root /var/lib/phpfiwa
sudo chown www-data:root /var/lib/phpfina
sudo chown www-data:root /var/lib/phptimeseries
Однако в самом дистрибутиве, в файле settings.ini, указаны другие пути - /var/opt/emoncms/
Нужно либо создавать пути, как указано в settings.ini, либо поменять в settings.ini на созданные при установке.
Чтобы работали логи
# mkdir /var/log/emoncms
# touch /var/log/emoncms/emoncms.log
# chmod 666 /var/log/emoncms/emoncms.log